ALGORITMOS DE ALINHAMENTO DE SEQÜÊNCIAS MOLECULARES

Autores

  • E. Bilha
  • E. di Grazia
  • L. T. Ono
  • M. R. Cardoso
  • M. C. Smynniuk
  • L. C. Rozante

DOI:

https://doi.org/10.13037/ria.vol1n1.891

Palavras-chave:

Similaridade, Programação Dinâmica, Comparação de Sequências, Alinhamento Múltiplo

Resumo

Com o advento e crescimento da bioinformática, em especial, com o sequenciamento do genoma de vários organismos, inclusive do homem, os bancos de biosequências cresceram em tamanho e número. Isto levou à necessidade de novas técnicas métodos de análise e tratamento destas informações, sendo um dos mais importantes, o tratamento do problema de busca e alinhamentode sequências moleculares. Para isto, existem duas famílias principais de algoritmos, a família FAST e a família BLAST, sendo esta última a mais utilizada. O objetivo dos sistemas baseados nestes algoritmos é fornecer aos pesquisadores em biotecnologia ferramentas de comparação e busca entre diversas sequências. Neste trabalho, apresentamos um modelo baseado nos algoritmos da fampilia BLAST e são demonstrados, além do funcionamento destes, exempls de alinhamentos. Descrevemos o funcionamentode algoritmos para o alinhamento de sequências de DNA, baseados em programação dinâmica, incluindo um algoritmo de alinhamento múltiplo, conhecido como Estrela.

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Publicado

2010-08-03

Como Citar

Bilha, E., di Grazia, E., Ono, L. T., Cardoso, M. R., Smynniuk, M. C., & Rozante, L. C. (2010). ALGORITMOS DE ALINHAMENTO DE SEQÜÊNCIAS MOLECULARES. Revista De Informática Aplicada, 1(1). https://doi.org/10.13037/ria.vol1n1.891

Edição

Seção

Artigos Originais